Este Instituto comenzó a impartir enseñanza en la calle Alameda de Urquijo 49, Indautxu, en el año 1916, hasta que en el año 1948 tuvo que trasladarse a la calle Particular de Alzola, número 9, en La Casilla y en el año 1966 pasó a desempeñar su labor educativa en la actual ubicación en la calle Zabalbide 116. 

Impregnado de un espíritu inquieto e innovador desde sus orígenes, éste lo ha mantenido hasta la actualidad, adaptándose a los nuevos tiempos y respondiendo adecuádamente a los retos que la sociedad presenta.

Los hitos más significativos de estos últimos años son:

1998-1999

Comienza la implantación del modelo B.

2002-2003

Se pone en funcionamiento la Escuela Infantil de 0 a 3 años, con tres aulas.

2008-2009

Obtención del reconocimiento Q de Plata de Euskalit. 
Obtención del primer diploma de Escuela Sostenible. 
Apertura de nuevas aulas. 
Impulso educativo con la participación en distintos proyectos: Normalización Lingüística, Agenda 21 escolar.

2010-2011

Introducción del modelo trilingüe de enseñanza.

2012-2013

Impulso al Proyecto “Puxika” de apoyo escolar de Cáritas Diocesana de Bizkaia.

Obtención del segundo diploma de Escuela Sostenible. 

2013-2014

Impulso al Proyecto de Aprendizaje Cooperativo.
Puesta en marcha de la enseñanza digital, proyecto IKASDIG.

2015-2016

Obtención del diploma de madurez TIC, otorgado por el departamento de Educación.

2016-2017

Celebración del Centenario de la presencia de las Avemarianas en Bilbao y a su vez de la celebración de las Bodas de Oro de El Ave María en la calle Zabalbide.

Obtención del tercer diploma de Escuela Sostenible. 

2020-2021

Obtención del cuarto diploma de Escuela Sostenible.